フラグメントスクリーニングの手法とライブラリ規模、実践者の選択とその根拠
- FBDDの基本的な設計上の選択、つまりスクリーニング手法とフラグメントライブラリの規模を論じた、単著の展望記事。
- 著者は自分の研究室で採用している手法とライブラリ規模を示し、それぞれを選んだ理由を述べている。
- 実例を挙げて利点を説明しているが、実践のあり方は多様なので、あくまで一つの見解として提示されている。
💡 ポイント アブストラクトに基づく見解
ライブラリ規模はヒット率やリガンダビリティと並べて初めて意味を持つ。よく選別した数百のフラグメントから、可溶性が高く直交法で確認できた結合体が得られるなら、ノイズの多い単一の読み出しで数千を回すより優れることもある。手法を選ぶ際に確かめるべきは、結晶構造で検証されたヒットの数とそのリガンド効率で、伸ばせるかどうかはそこで決まる。
What Method and Library Size Is Best for Fragment Screening? ↗