扩散对接后训练:聚焦式监督未能超越广谱继续训练
- 研究以DiffDock为对象,在固定训练预算下,比较了常规继续训练、聚焦扭转角的监督以及二者混合的方案。
- 评估将得分场保真度、构象质量、十次采样的最佳结果和按置信度排序的Top-1成功率分开衡量。
- 在各训练方案中,常规继续训练的Top-1成功率最高,聚焦式或混合监督没有表现出一致的优势。
💡 要点 基于摘要的观点
这类阴性结果有价值,但Top-1取决于DiffDock的置信度模型,若后训练没有触及它,得分场保真度的提升在这一指标上可能看不出来。我想看随机种子间的方差、PDBBind到PoseBusters的差距,以及加上物理合理性过滤后的成功率。放到我们自己的交叉对接靶点上,而不是留出的基准集,结论还成立吗?