2026-10-23

今日科学内容6篇:口服STING抑制剂、摆脱BRD4脱靶问题的TLR7/8拮抗剂、让BRD9 PROTAC在小鼠中起效的方法、含溶剂的配体应变计算、抗微管吡咯并喹啉,以及面向胶质瘤的BCL9/β-catenin抑制剂。行业新闻2条:礼来–Metis脂质纳米颗粒合作与Isomorphic Labs估值融资传闻。

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药物化学

4篇

BRD9 PROTAC在小鼠中效果不佳的原因及E3人源化解决方案

  • dBRD9、VZ185等常用的CRBN和VHL类BRD9降解剂在小鼠细胞中的活性明显下降,尽管BRD9本身高度保守。
  • 差异指向E3连接酶的物种差异,尤其是Crbn的I391残基和VHL的结构变化,很可能妨碍三元复合物形成。
  • 表达人CRBN或VHL,或引入CrbnI391V突变,可恢复小鼠细胞中的活性,并提升体内BRD9降解。
💡 要点

凡是见过PROTAC在人源细胞系里表现出色、到小鼠药效实验里却毫无起色的人,对此都不会陌生。啮齿类中降解剂的PK/PD失败,可能出在E3而非化合物本身,因此尽早建立CrbnI391V或人源化E3模型很有价值。在判定某个系列无效之前,也应先跨物种评估三元复合物的形成。

Improving PROTAC-Mediated Degradation in Mouse Models: BRD9 as a Case Study ↗

吡咯并喹啉类抗微管药物在紫杉醇和柔红霉素耐药细胞中保持活性

  • 研究合成了1H-吡咯并[3,2-c]喹啉化合物库并梳理SAR,得到抗增殖活性达低纳摩尔水平、对正常成纤维细胞选择性极高的化合物。
  • 最佳衍生物在柔红霉素和紫杉醇耐药亚系中仍保持活性,外排比较低,提示交叉耐药有限。
  • 先导化合物吸收迅速、半衰期适中、脑渗透有限,但斑马鱼胚胎毒性提示治疗窗较窄。
💡 要点

能躲开P-gp外排的微管结合剂始终受关注,外排比低且在耐药株中保持活性,是合理的第一道筛选。斑马鱼结果是不留情面的提醒:强效抗有丝分裂药物的安全边际往往很窄,培养中对成纤维细胞的选择性解决不了安全性问题。下一步我想看结合位点,以及这个骨架还能向更宽治疗窗方向调整多少。

Design, Synthesis, and Biological Evaluation of 1H-Pyrrolo[3,2-c]quinolines as Potent and Selective Antitubulin Agents Active against Drug-Resistant Cell Lines ↗

阻断棕榈酰化的口服STING抑制剂在炎症模型中显示疗效

  • 研究者构建了四氢吡唑并[1,5-a]吡嗪系列,作为STING抑制剂;STING是多种干扰素病和自身免疫病背后的天然免疫接头蛋白。
  • 先导化合物37在细胞中抑制STING效果显著,口服暴露良好,安全性也较理想。
  • 其机制是阻止STING棕榈酰化,从而关闭下游信号通路。
  • 口服给药在化学刺激急性模型和Trex1缺陷小鼠等模型中减轻了炎症。
💡 要点

此前STING抑制剂多为工具化合物或共价结合物,而一个靠阻断棕榈酰化起效、可口服的化学型,等于为该靶点提供了另一条思路。我想知道它究竟是结合Cys91口袋还是作用于更上游,这决定了对其他棕榈酰化蛋白的选择性。对自身免疫适应症而言,Trex1小鼠的数据最有说服力。

Discovery of Novel Orally Bioavailable STING Inhibitors with 4,5,6,7-Tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazine Moiety for STING-Mediated Inflammatory Disorders ↗

从红斑狼疮用TLR7/8双重拮抗剂中设计剔除BRD4风险

  • 对2-(吡啶-2(1H)-酮)吲哚进行基于结构的优化,得到渗透性更好、离子通道活性更低、稳态分布容积更小的TLR7/8双重拮抗剂。
  • 早期吡啶酮先导化合物出人意料地抑制免疫细胞增殖,团队推测原因是BRD4脱靶。
  • 通过优化去除BRD4结合后,抗增殖效应消失,而在人全血中对TLR7/8驱动的IL-6产生仍保持强效抑制。
💡 要点

细胞组合中出现异常毒性,先提出机制假说,再用SAR把两种活性分开,这是表型导向脱靶排查的一个干净范例。内体TLR7/8拮抗剂既要能透膜又要高选择性,而平面性强的杂芳环很容易落入BRD4这个陷阱。把这一办法借用到其他骨架之前,我想先看吡啶酮在TLR7/8二聚体界面的结合模式。

Structure-Based Design of 2-(Pyridone)Indoles as Antagonists of the Toll-Like Receptors TLR7 and TLR8 for the Treatment of Autoimmune Disorders ↗

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药理

1篇

BCL9/β-catenin小分子阻断剂在胶质母细胞瘤细胞中接受检验

  • BCL9是β-catenin的共激活因子,此前缺乏小分子抑制剂,因此其在胶质母细胞瘤中的治疗价值尚未经药理学验证。
  • 新型抑制剂ZD37-28R经对接预测可结合β-catenin,并在体外破坏了BCL9/β-catenin相互作用。
  • 它抑制β-catenin驱动的转录,并降低U87-MG和U251胶质母细胞瘤细胞的增殖与迁移。
💡 要点

Wnt/β-catenin一直是小分子药物的坟场,针对BCL9的选择性PPI阻断剂比直接打β-catenin更可行。遗留问题是PPI项目的老问题:需要直接的生物物理结合证据而不只是对接,需要对其他β-catenin结合伙伴的选择性,以及胶质瘤所需的脑暴露。目前应视为靶点验证工作,还谈不上先导化合物。

Pharmacological Study of Novel Small-Molecule Inhibitors Targeting B-Cell Lymphoma 9/β-Catenin in the Treatment of Glioma ↗

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含溶剂的神经网络势能让配体应变估算可用于整库规模

  • 传统应变估算以气相单一极小构型为参照,忽略溶剂,还会让带电配体在真空中因分子内静电作用坍缩成紧凑构象,从而扭曲结果。
  • AIMNet2-CPCM是在连续介质溶剂中以DFT级能量和力训练的神经网络势能,对中性和带电物种一视同仁。
  • GPU批量推理使得对整个筛选库做含溶剂的全局极小搜索成为可能。
  • 在约8000个PDB配体上,含溶剂应变随净电荷增加,该趋势在电荷达−2时仍成立。
💡 要点

应变过滤的可靠程度取决于未结合态的参照,见过两性离子在真空中折叠出盐桥的人都明白气相数值为何会误导。速度足以做库分筛的含溶剂、电荷感知势能,是我真会放进对接后过滤环节的工具。需要留意的是负电荷更高时可靠性下降,这对含酸和磷酸基的分子很关键。

Efficient and Accurate Ligand Strain Calculations in Solution with the AIMNet2 Neural Network Potential ↗

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行业新闻

2篇

Isomorphic Labs传出高估值,抬高AI药物发现的赌注

  • STAT的AI Prognosis专栏探讨Isomorphic Labs的极高估值对AI在药物研发中的角色意味着什么。
  • 另有报道称,公司在2026年5月完成约21亿美元融资后不久,正初步洽谈以至少400亿美元估值再融资;融资尚未完成。
  • 专栏还涉及围绕AI与医疗成本的争论。
💡 要点

这一档估值计入的是平台的可能性,而非管线:Isomorphic尚无公开的临床阶段验证,投资者押注的是结构预测AI能缩短到首个候选药物的路程。对行业其他公司而言,这抬高了AI原生生物技术公司需要拿出的临床证据门槛,合作资金也会向领先者集中。该数字只是洽谈阶段,并非已成交的交易。

STAT+: What's the deal with Isomorphic Labs? ↗

礼来押注Metis的AI平台,开发组织靶向脂质纳米颗粒

  • 礼来与香港上市的METiS TechBio达成合作,总额最高约11亿美元,用于开发组织特异性递送技术。
  • METiS提供AiLNP平台,用于可电离脂质发现,结合大型脂质库、筛选和脂质语言模型。
  • Metis可获得数千万美元级别的首付款,以及开发、监管和商业里程碑付款和个位数百分比的阶梯式特许权使用费;未披露候选药物或适应症。
💡 要点

标题中的金额几乎全是附条件的,真正的信号是数千万美元的首付款:礼来买的是递送化学的选择权,而不是某个资产。肝外LNP靶向是基因药物的瓶颈,礼来正围绕这一点不断叠加合作。对LNP设计领域的竞争者而言,关键在于AI生成的脂质库能否在体内展现可重复的组织选择性。

Lilly partners with Hong Kong's Metis in $1.1B deal to bolster AI nanoparticle discovery ↗

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