分子动力学指导设计选择性FGFR1不可逆抑制剂

  • 分子动力学模拟发现,FGFR1的P环构象不同于其他FGFR亚型,为实现亚型选择性提供了依据。
  • 通过限制连接子的构象自由度进行优化,获得了高活性、高选择性的共价FGFR1抑制剂化合物24。
  • 模拟显示其弹头与P环半胱氨酸的空间位置有利于成键,形成共价加合物后仍保持与铰链区的作用,并与FGFR1特有构象相匹配。
  • 化合物24在细胞以及CDX和PDX模型中均能抑制FGFR1依赖性肿瘤的生长。
💡 要点

FGFR1的P环半胱氨酸形状与众不同,针对它可以获得可逆铰链结合剂很难给出的亚型选择性。让我犹豫的是,结论有多少建立在模拟之上:选择性是否在全激酶组范围内实测过,弹头反应性是否调得足够温和、不致脱靶?连接子刚性化则是可以带回自己项目里的实用经验。

Rational Design of Potent and Highly Selective FGFR1 Irreversible Inhibitors Guided by Molecular Dynamics Simulations ↗