空间转录组的区域表达特征比bulk RNA更能提升抗癌化合物的预测排序
- bulk RNA特征会抹平肿瘤内部差异，因此作者改用局部空间表达特征为化合物打分，重点关注异质性很强的三阴性乳腺癌。
- 他们在约1300个多样化合物上比较了bulk特征与空间特征，考察两者对已知抗癌药的排序能力。
- 空间特征对已知抗癌药的排序优于bulk特征，还提示了未分类及非肿瘤类化合物可能具有抗癌潜力；证据为计算层面，摘要未提及实验验证。
💡 要点 基于摘要的观点
已知抗癌药排名靠前，只是单一癌种上的回顾性富集测试，并不能证明空间特征能找出新药。没有湿实验跟进，摘要也没交代数据泄漏和基线对比。最有意思的是非肿瘤类的命中，但要等其中几个真正被验证后，我才会下判断。