结合REST的炼金转移FEP表明,带电核定位肽与输入蛋白α的结合由水和离子释放带来的熵驱动
- 炼金转移FEP通过交换结合态与游离态肽，免去净电荷校正，并与溶质回火副本交换及软性平底约束联用。
- 将其用于病毒来源的带电核定位肽与输入蛋白α的结合，在统计误差较小的情况下实现了充分采样。
- 等温滴定量热实验与计算所得亲和力中等程度吻合。
- 能量分解显示，界面水和离子被排出使净焓变不利，但熵增予以补偿，因此该结合属于熵驱动。
💡 要点 基于摘要的观点
仅有输入蛋白α/NLS肽这一个体系，ITC吻合度也只是中等，并不足以说明该方案可靠。熵驱动的解读依赖水和离子的分解，而这一分解会随力场和离子参数而变。需要把量热法测得的焓变与计算值直接对照，并在同一体系上与标准双重解耦法或MM-GBSA比较。