CESAR:引用扩展结合大模型筛选,让药物发现文献综述自动化

  • CESAR是一个开源工作流:通过OpenAlex沿参考文献和施引文献扩展语料,再由经人工标注参照集校准的大模型筛选摘要。
  • 在宽泛领域(全合成)和狭窄靶点(MAGL)上,以既有人工整理的文献集做回顾性验证;语料覆盖了大部分已知文献,廉价模型的表现接近昂贵模型。
  • 开源权重模型在本地运行即可达到云端水平,并能同步提取选择性与化合物名称,适合处理保密资料。本文为预印本,未经同行评审。
💡 要点 基于摘要的观点

“覆盖了大部分已知文献”只是对照人工整理文献集得到的召回率,而这些文献集很可能与扩展所用的文献和引用关系同源,所以几乎说明不了会漏掉什么。用到自己的靶点之前,先从被排除的摘要里随机抽样人工复核,估一下假阴性,因为文献全景悄悄出偏差的地方正是这里。

Orchestrating literature landscaping in drug discovery by coupling citation expansion with large language models ↗