已获批药物的对接筛选提示沙奎那韦与拉替拉韦可能成为靶向ClpP1的抗结核先导
- 研究将已获批药物对接到结核分枝杆菌ClpP1晶体结构的S1口袋,沙奎那韦和拉替拉韦排名最佳。
- 长时间分子动力学模拟显示两者都能稳定留在口袋中。
- 体外实验中,两者对结核分枝杆菌减毒株均表现出浓度依赖的生长抑制,沙奎那韦更强;但未直接证明与靶点结合,作用机制和临床前研究仍有待开展。
💡 要点 基于摘要的观点
对接排名加稳定的分子动力学轨迹成本很低,但二者都不能证明结合。全细胞生长抑制,除ClpP1之外还有许多可能的解释。显而易见的下一步是做ClpP1酶活性或直接结合实验,最好再用对接排名靠后的药物作阴性对照。