MERIT:不依赖化合物身份,仅凭作用机制预测试验结局,并锁定盲态的 III 期预测
- 许多试验结局预测模型依赖试验设计、研发史或化合物身份,容易“记住”化合物;MERIT 只使用分子和疾病特征,通过药物–蛋白、蛋白–代谢物和免疫相互作用图谱,把预期作用与脱靶作用关联到组织特异的疗效与安全性。
- 在数百个小分子药物、数千项试验上采用结构留出评估,优于在相同折叠上重训的两种已发表方法。
- 在一组预先选定、于某一适应症失败但在另一适应症获批的药物中,多数情况下它把获批适应症排在失败适应症之前;作者还为进行中的 III 期药物–适应症组合登记了锁定且对结局盲态的预测。
💡 要点 基于摘要的观点
去掉化合物身份和试验设计是应对数据泄漏的正确做法,结构留出也比多数评估更严。但整体 AUROC 不是项目组真正关心的问题:“此处失败、别处获批”的排序只有在非显而易见的案例上成立才有价值,我会把那 60 个化合物逐个看一遍。锁定的 III 期预测才是真正的检验,在读出结果之前,我不会把它带进 Go/No-Go 讨论。
MERIT: Mechanism-Driven Model Predicts Drug Outcomes and Nominates Indications for Failed Drugs ↗