挖掘15万份肿瘤RNA测序数据,发现识别癌症抗原的公共TCR
- 对约15万名患者的常规临床肿瘤RNA测序数据进行统计挖掘,发现与已知癌症抗原(HLA呈递的HPV、突变KRAS和CT83等)相关的反复出现的共享TCR链。
- 研究者开发了将富集的α链与β链配对为完整受体的方法,并检测候选TCR的抗原识别能力。
- 在九个肽-HLA靶点上验证了数十个TCR,其中部分具有强细胞毒活性,提示公共抗癌TCR普遍存在,可成为TCR类疗法的新来源。
💡 要点 基于摘要的观点
公共TCR的吸引力在于一个受体可以服务很多患者,但HLA限制仍然决定了能入组的人群。要把其中任何一个推进下去,我首先想看到针对正常肽库和原代组织的交叉反应筛选,因为体外杀伤很强并不能说明脱靶风险。突变KRAS和CT83在这一点上差别很大,仅凭体外细胞毒活性,看不出哪一个更安全。
Cancer-specific T cell receptor discovery using 150,000 clinical genomics samples ↗