图神经网络筛选将卡维地洛重新定位为THRβ部分激动剂,并获实验验证
- 研究采用分层流程,依次结合图神经网络筛选、对接与自由能重打分以及分子动力学,寻找与脂肪肝相关的结构新颖的THRβ激动剂。
- 调优后的网络在从内部化合物库中对活性分子排序时,优于传统机器学习方法。
- 卡维地洛成为候选分子;共激活因子招募的生化实验和细胞脂质实验支持其为与临床对照药resmetirom相近的部分激动剂,模拟结果则提示了口袋内的关键相互作用。
💡 要点 基于摘要的观点
卡维地洛是老牌β受体阻滞剂,它在THRβ上出现活性很有意思,但仍需谨慎看待。我首先想知道它对THRα的选择性、对心脏的影响,以及起效浓度是否远高于患者实际能达到的暴露水平。GNN胜过基线的结论同样取决于数据划分方式;只有按骨架划分来检验,才能判断它能否推广到库之外的分子。
📄 原论文 · Journal of Chemical Information and Modeling (ACS) ↗ AI-Driven Discovery Pipeline Identifies Carvedilol as a Novel Partial Agonist of THRβ