诱导契合对接结合自由能微扰,使结构导向设计可用于混杂性ADMET反靶点
- 将诱导契合对接与自由能微扰结合,用于模拟柔性且混杂的反靶点蛋白:CYP3A4、CYP2D6、hERG和PXR。
- 在同系列化合物中强制采用统一的结合模式,使流程能高效采样多种受体构象。
- 既在公开数据集上进行回顾性评估,也在进行中的药物发现项目中前瞻性应用,助力规避脱靶风险的先导化合物优化。
💡 要点 基于摘要的观点
统一结合模式的假设既是巧思也是风险:在hERG和CYP3A4上,同一系列配体可能翻转结合方式,强行统一会悄悄扭曲排序。我想看到同一数据集上不含FEP的基线(基于配体的QSAR或简单对接),以及结合模式失效的案例。前瞻性应用令人鼓舞,但这里并未给出命中率。
📄 原论文 · Journal of Chemical Theory and Computation (ACS) ↗ Accelerating Lead Optimization Away from Anti-Targets: Navigating the Structural Complexity of Promiscuous ADMET Proteins