归档 · 2026年 · 2026年10月

2026-10-20 每日摘要

2026-10-20

今日科学5篇:从细胞内暴露重新解读PROTAC靶点结合、可入脑的PARP1选择性抑制剂、共价环氧琥珀酸酯类PLpro抑制剂、ISG15–UBA7的AlphaLISA筛选、激酶抑制剂的质子化状态。行业新闻为Gilead口服UC数据与默克KGaA收购Silence。

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药物化学

4篇

环氧琥珀酰胺弹头对PLpro效果显著,但酰肼连接子成为代谢短板

  • 研究把作用于Cys-111的环氧琥珀酰胺弹头,与非共价抑制剂常用的BL2沟槽结合要素相结合,设计共价PLpro抑制剂。
  • 化合物酶学活性极高,在细胞培养中显著降低病毒滴度。
  • 柔性酰肼连接子会被肝羧酸酯酶水解,替换连接子均未成功,系列受限于代谢稳定性。
💡 要点

弹头很强却在肝脏里被降解,这种事并不陌生,而这里被切的恰是够到Cys-111所必需的连接子。为下一次冠状病毒疫情,我仍会把环氧琥珀酰胺留在工具箱里,但首先要重新设计的是连接子。

Discovery of Epoxysuccinates as Potent Covalent Inhibitors of SARS-CoV-2 Papain-like Protease ↗

替换saruparib的甲酰胺,获得口服、可入脑的PARP1选择性抑制剂

  • 研究针对中枢神经系统肿瘤,将saruparib的甲酰胺替换为多种杂环,以PARP1选择性避开PARP2,从而降低血液学毒性。
  • 筛选时用Caco-2外排代替常用的MDR1-MDCK,挑出脑内游离暴露良好的化合物。
  • 先导化合物口服生物利用度良好,低剂量即可在异种移植模型中使肿瘤消退,预测临床剂量也较低。
💡 要点

替换甲酰胺相当大胆,这个基团本是锚定烟酰胺口袋的关键,杂环居然保住了结合。更值得借鉴的是筛选方式:若Caco-2外排比MDR1-MDCK更能预测脑内游离暴露,不少CNS项目可能已错杀了好化合物。

Discovery of Potent, Orally Bioavailable, and CNS-Penetrant 1,2,3-Triazolopyridinyl Piperazine-Based PARP1-Selective Inhibitors ↗

PROTAC靶点结合的差异,主要来自细胞内暴露而非E3识别

  • 研究在细胞内NanoBRET竞争实验中,以cereblon和VHL示踪剂评估了20个E3配体、连接子和靶点配体各异的PROTAC。
  • 按添加浓度计算时表观活性差异很大,被动Caco-2通透性几乎无法解释这种差异。
  • 用实测的细胞内游离暴露量校正后,差异明显缩小,并与通透化细胞中的结果吻合。
💡 要点

以后读PROTAC的SAR表,我会先问细胞实际接触到多少药物,再谈E3亲和力。若差异主要来自游离暴露量,看似提高活性的连接子改造可能只是提高了通透性。尽早测量暴露,才不会追错变量。

Exploring the Relationship between Cell Permeability, Intracellular Exposure, and Target Engagement for PROTACs ↗

AlphaLISA筛选平台为ISG15–UBA7相互作用抑制剂的发现打开通路

  • ISG15及其E1酶UBA7驱动ISG化修饰,该通路与肿瘤耐药相关,但目前尚无抑制剂。
  • 作者建立了检测ISG15–UBA7相互作用的AlphaLISA方法,稳健性指标适合高通量筛选。
  • 小型化合物库的先导筛选得到少数命中,其中两个在细胞中也能降低ISG化。
💡 要点

这只是不足千个化合物的先导筛选,命中物算起点而非先导化合物。关键在于,泛素样修饰分子与E1之间的蛋白质相互作用终于有了可筛选的形式。我会用真实的多样性库去跑,并严格做AlphaLISA干扰物的反筛。

A High-Throughput Screening Platform for the Discovery of Noncovalent Inhibitors of the ISG15–UBA7 Interaction ↗

MCCE计算显示:激酶抑制剂结合时常改变质子化或互变异构状态

  • 研究对9个激酶结构域与18种已获批抑制剂的37个共晶结构应用了多构象连续静电(MCCE)计算。
  • 结合时蛋白质净电荷基本稳定,而抑制剂的电荷状态常常上升或下降。
  • 结合可使溶液中近乎等量的两种互变异构体归并为一种,产生数个kcal/mol的自由能差。
💡 要点

大多数虚拟筛选都默认采用单一固定的质子化状态,而这项工作表明,即便对已获批药物,这也可能造成数kcal/mol的偏差。以后遇到含可互变异构杂环的骨架在SAR中表现异常,我会先查结合态互变异构体,再怪口袋。

Kinase Inhibitors can Change Protonation or Tautomeric State upon Binding ↗

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行业新闻

2篇

Gilead口服emvistegrast在溃疡性结肠炎2期试验中达到主要终点

  • Gilead每日一次口服α4β7整合素抑制剂emvistegrast(GS-1427)在溃疡性结肠炎2期SWIFT研究中达到主要终点。
  • 200 mg剂量组第12周临床缓解率约为安慰剂组的三倍,具名义显著性,耐受性良好。
  • STAT原文需付费,此处数据依据Gilead自身声明。
💡 要点

针对注射用vedolizumab推出口服α4β7阻断剂,思路再明确不过,安慰剂校正后约23个百分点的缓解率对2期也算可信。但p值只是名义上的,各组样本量也小,口服便利性能否变现,取决于3期以及武田稳固的生物药阵地,而不是这次读数。

Gilead’s IBD drug eliminated symptoms for patients, mid-stage study finds ↗

默克KGaA在siRNA 2期获胜后以约13亿美元收购Silence Therapeutics

  • 默克KGaA将以每份ADS 20美元现金、通过英国协议安排方式收购Silence,股权价值约13亿美元。
  • 该价格较此前收盘价溢价130%,Silence称这是竞争性出售流程的结果。
  • 交易源于Silence的siRNA药物divesiran在真性红细胞增多症2期试验中的积极数据。
💡 要点

为单一中期资产支付130%溢价,说明默克KGaA买的是风险已降低的罕见血液病数据和经验证的平台,而非产品线宽度。公司需要填补增长缺口,siRNA正好是可嵌入的新模态。要看Silence平台能否作为独立引擎延续,还是只为divesiran服务。

Merck KGaA buys Silence in $1.3B deal after siRNA drug's phase 2 blood cancer win ↗